国家专项计划和高校专项计划主要有以下区别：
一、实施主体不同
国家专项计划：由国家部门组织实施，具体由教育部、国家发展改革委、财政部、人力资源社会保障部、国务院扶贫办共同制定实施办法，并联合组织实施。主要面向贫困地区的考生，旨在促进教育公平，为贫困地区学生提供更多进入重点高校的机会。
高校专项计划：又称农村学生单独招生，是由教育部直属高校和其他自主招生试点高校承担实施。这些高校根据自身的办学特色和需求，制定专项计划招生简章，面向特定区域的农村学生进行招生。
二、报考条件不同
国家专项计划：
考生需符合当年统一高考报名条件。
本人具有实施区域当地连续 3 年以上户籍，其父亲或母亲或法定监护人具有当地户籍。
本人具有户籍所在县高中连续 3 年学籍并实际就读。
高校专项计划：
考生需符合当年统一高考报名条件。
本人及父亲或母亲或法定监护人户籍地在实施区域的农村，本人具有当地连续 3 年以上户籍。
考生本人具有户籍所在县高中连续 3 年学籍并实际就读，且勤奋好学、成绩优良。一些高校可能还会对考生的学业成绩、综合素质等方面有特定要求。
三、录取方式不同
国家专项计划：一般在本科一批前开始投档录取，录取分数线原则上不低于招生学校所在批次科类录取控制分数线。具体录取方式根据各省份的招生政策和高校的招生计划而定，可能采用平行志愿投档，也可能采用顺序志愿投档。
高校专项计划：考生需要在规定时间内登录阳光高考平台进行报名，并提交相关材料。高校对报名考生进行初审，确定初审合格名单。初审合格的考生参加全国统一高考后，再参加高校组织的考核（部分高校可能只有面试，部分高校可能包括笔试和面试）。高校根据考生的高考成绩、高校考核成绩、学业水平考试成绩等综合情况，择优录取。
四、招生范围不同
国家专项计划：实施区域为集中连片特殊困难县、国家级扶贫开发重点县以及新疆南疆四地州等地区。这些地区通常是经济发展相对滞后、教育资源相对匮乏的贫困地区。
高校专项计划：主要招收边远、贫困、民族等地区县（含县级市）以下高中勤奋好学、成绩优良的农村学生。具体实施区域由各高校根据教育部要求和自身实际情况确定，一般比国家专项计划的实施区域范围更小、更具体。
五、招生院校不同
国家专项计划：招生院校为中央部门高校和各省（区、市）所属重点高校。这些高校在全国范围内具有较高的知名度和影响力，涵盖了综合性大学、理工类大学、师范类大学等多种类型。
高校专项计划：招生院校为教育部直属高校和其他自主招生试点高校。这些高校在教学质量、科研水平、师资力量等方面具有突出优势，通常在国内乃至国际上都有较高的声誉。
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